未知の領域が多く、さまざまな課題が山積するがん研究の分野。その最先端の現場で今、注目されているのが、米国のアルゴンヌ国立研究所、オークリッジ国立研究所、フレデリック国立がん研究所などが共同で進めている「がん分散学習環境(CANDLE)プロジェクト」だ。このプロジェクトの目的は、がん研究に特化した高度なコンピューティングソリューションの設計を支援、促進することにある。
このプロジェクトから生まれた、あるハイパフォーマンスコンピューティング(HPC)マシンでは現在、大量のデータを扱う、かつてないほど大規模の機械学習、ディープラーニングのためのアーキテクチャが構築され、稼働している。がん研究の分野で“解決不可能だった課題”の解決に貢献するものとして、大きな期待を寄せられているという。
本資料では、最先端がん研究の現場で、HPCが果たしている役割および、それを活用して不可能を可能にしようという研究者たちの取り組みについて紹介する。プロジェクトの中心人物の1人が今、CANDLEプラットフォームのさらなる最適化にベンダーと協業で取り組んでいる点にも注目したい。
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